Im See leben viele hungrige Bachsaiblinge, die jedoch kleinwüchsig und teilweise degeneriert sind. Daher gelten für Saiblinge weder ein Fangmass noch eine Fangzahlbeschränkung. Vereinzelt kommen noch Namaycush vor, die aus früheren Besatzmassnahmen stammen. Der Kanton verzichtet beim Hüenersee heute vollständig auf weiteren Besatz.