Seesaiblinge entwickeln in verschiedenen Seen unterschiedliche Lebensgewohnheiten. Sie benötigen klares, kaltes, sauerstoffreiches Wasser und halten sich bevorzugt in tiefen Wasserzonen auf:
- steil abfallender Bacheinlauf
- steil abfallende Ufer / Geröll haltig
- Felswände
- Unterwasserquellen
Gegenüber der Wassertemperatur ist der Seesaibling einer der am besten angepassten Fische für Bergseen, da er bis zum Gefrierpunkt aktiv ist. Auf höhere Wassertemperaturen reagiert er hingegen sehr empfindlich.