Die Appenzeller Fischereiverwaltung setzt sich für eine nachhaltige Nutzung der Fischbestände und den Schutz der aquatischen Lebensräume ein. Der Kanton verfügt über drei Bergseen sowie über den Fluss Sitter und seine Zuflüsse. Gefischt wird im Patentsystem, ein Freiangelrecht gibt es nicht.

Mit einem Tagespatent dürfen die drei Bergseen befischt werden, mit einem Wochenpatent zusätzlich auch Flüsse und Bäche. Jahrespatente sind den Einheimischen vorbehalten. Für den Erwerb eines Patents ist ein Sachkundenachweis erforderlich. An Sonn- und Feiertagen gilt ein Fangverbot.